激光散斑血流成像系統可用于確認已發生MCA閉塞并發生缺血。通過成功的手術，可以測試各種療法來評估對卒中恢復的影響。可完整的記錄樣本從缺血-再灌注-術后改善整個過程。

CBF的變化是許多神經系統疾病的特征，如腦損傷、腦血管病、血管性癡呆等。利用激光散斑血流成像系統LSCI技術非侵入性的方式和出色的成像分辨率來量化血流變化，能更好地了解這些事件背后的神經生理機制。

缺血周邊組織發生擴散性抑制樣去極化是組織損害擴大的另一個原因。腦皮層擴散性抑制的評價是動態的過程，轉瞬即逝，常規離體的方式無法有效觀察急性變化的過程，缺乏有效的數據來支持研究。

下肢缺血模型是一種成熟的血管再生研究動物模型，可用于測試和量化新療法對新血管形成和發育的影響，利用激光散斑血流成像系統軟件自定義缺血肢體與非缺血肢體血流的感興趣區域，量化的數據對比來評估不同療法的效果。

皮下腫瘤模型是新型抗癌候選藥物體內評價非常受歡迎的動物模型。使用免疫缺陷動物品系，將培養的癌細胞皮下植入，約2周內會即可形成實體瘤。研究者通過監測腫瘤生長和進展，結合腫瘤微血管密度測定，來評估治療策略的效果。

膿毒癥和急性腹腔內炎癥狀況影響內臟循環目前已獲得普遍共識。低灌注是麻醉和危重病的常見特征。可通過腸系膜微循環變化來揭示多種疾病的發病機理、篩選有效藥物、判斷疾病變化及預后等。

脊髓損傷仍然被認為是一種無特殊治療方法的傷病。缺血再灌注損傷是造成神經損傷的一個重要因素，視頻記錄了大鼠脊髓通過打擊器損傷后從缺血到再灌注的完成過程。

傳統的動態觀察腎臟微循環的方式為在活體或者灌流腎中建立腎盂給水動物模型進行研究，這種方式難以符合腎臟的生理狀態。目前利用激光散斑血流成像系統來評價腎臟微循環灌注，對腎臟損傷小，結果可靠。

CAM是一種高度血管化、無神經支配的胚胎外膜，對于血管再生研究，可以局部遞送各種生物分子和藥物并研究它們的血管生成效果。對于癌癥模型，可以將各種類型的細胞移植到 CAM 中以促進腫瘤生長。

皮膚的血流監測，在針灸、化妝品開發、過敏、皮膚損傷愈合的應用十分普遍。可以利用分析軟件在皮膚的不同區域進行區域標記以量化實驗前后的對比數據，結合血流灌注圖像來評估療效。